考虑到各地情况差异较小，环保税法在限于税额方面给与地方一定的许可。根据该法，增值税大气污染物和水污染物明确限于税额的确认和调整，由省、自治区、直辖市人民政府专责考虑到本地区环境承载能力、污染物废气现状和经济社会生态发展目标拒绝，在该法《环境保护税税目税额表格》规定的税额幅度内明确提出，报同级人大常委会要求，并报全国人大常委会和国务院备案。在环保税法实施后，各省份相继草拟限于税额和增值税污染物项目数方案，并向社会印发。9月29日，福建省人大常委会通过该省环境保护税限于税额和增值税污染物项目数方案，确认该省大气污染物限于税额为每污染当量1.2元；水污染物限于税额为五项重金属（总汞、总镉、总铬、总砷、总铅）、化学需氧量和氨氮每污染当量1.5元，其他水污染物每污染当量1.4元。
“福建遵循‘税负旋转’的基本原则，在全国首度要求环境保护税限于税额和增值税污染物项目数，为2018年1月1日环境保护税成功税奠下了坚实基础。”福建省地税局有关负责人回应。10月初，贵州省人大常委会通过了该省大气污染物和水污染物环境保护税限于税额，具体大气污染物税额标准为每污染当量2.4元，水污染物税额标准为每污染当量2.8元。
这个税额比贵州现行排污费征税标准提升一倍。据报，目前贵州废气、废水排污费继续执行的是国家规定的最低标准。随着工业出厂价格指数下跌，经测算，该省目前大气污染物的管理成本大约为每污染当量2.6元，水污染物的管理成本大约为每污染当量2.8元。
贵州省财政厅指出，这个标准正处于全国中下水平，并与周边省份相似，一定程度上防止了与周边省份税负差异过大而造成“产业与污染移往”的负面效应。记者了解到，江苏、浙江、广东、重庆等省市也都根据各自情况，发布大气污染物和水污染物环境保护税限于税额方案的印发稿。
比如，10月24日，重庆市发布的印发稿规定，增值税大气污染物环境保护税限于税额为每污染当量3.5元；增值税水污染物环境保护税限于税额为每污染当量3元。
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